作为异于人类的变种生物,师父斯普林特和忍者神龟组成的“龟鼠家庭”一直在下水道过着隐姓埋名的生活。然而四小只却一直向往着外面的世界。当他们得知神秘反派超级苍蝇为非作歹、祸乱城市时,战胜邪恶、主持正义,进而被人类社会接纳的想法油然而生。当他们历尽艰辛,终于追踪到超级苍蝇时,却发现他及其手下同样也是变种生物。不过,遇到同类的喜悦很快被超级苍蝇想要毁灭人类世界的阴谋冲散。面对来势汹汹意欲统治地球的变种大军,四小神龟勇敢迎敌,一场翻天覆地的正邪较量即将上演!而当面对“中文台词”的表演时,本·维特利导演在此前的采访中曾表示,“有点担心自己不熟悉的台词表达,会影响对于演员表演的判断”。但在实际的拍摄过程中,吴京在用中文台词进行表演时的充沛投入,则让本·维特利导演感慨即使语言不同,但“当看到吴京的表情和动作时,就可以感受到他身上流露的情感”。